|
ПРОТЕОМ [ proteome ] Протеом - это совокупность всех взаимодействующих белков, содержащихся в клетке, в ткани, в органе, в системе органов, в организме.
Примеры: протеом миоцита, протеом плазмы крови, протеом жидкостей организма, протеом нервной системы.
Протеомика (proteomics) - направление биотехнологии, целью которой является исследование структуры, функций и взаимодействия белков, вырабатываемых генами определённой клетки, ткани, органа, систем организма, организма в целом. Протеомика использует методологию, методы и методики молекулярной биологии, биохимии и генетики. Результаты исследований белков организуются в виде базы данных с целью последующего использования в биологии и медицине.
Термины «протеом» (proteome), «протеомика» (proteomics) были введены в научную лексику в 1994-1997 гг. Марком Вилкинсом (Marc Wilkins), студентом Australia's Macquarie University, при выполнении своей квалификационной диссертации. Вначале Marc Wilkins придумал термин «протеином» (по аналогии с термином «геном»). Этим термином он обозначал совокупность всех белков (protein), вырабатываемых геномом, клеткой или тканью. Затем Marc Wilkins сократил термин «протеином» до «протеом».
В научной терминологии «-ик-» регулярная и продуктивная словообразовательная единица, образующая имена существительные которые обозначают научные направления, сферы занятий, характеризующиеся отношением к объекту, обозначенному мотивирующим именем существительным (или его основой).
Примеры: протеом-ик-а, динам-ик-а, статист-ик-а, генет-ик-а, лингвист-ик-а. В английском языке: proteomics noun plural but singular in construction.
Таблица 1. Молекулярные характеристики некоторых белков.
Модификация: Березов Т.Т., Коровкин Б. Ф. Биологическая химия. 3-е изд., М.: Медицина, 1998. 704 с. |
| Белки |
Молекуляр-
ная масса |
Число аминокис-лотных остатков |
Число полипеп-тидных цепей |
| Рибонуклеаза |
12640 |
124 |
1 |
| Лизоцим |
13930 |
129 |
1 |
| Миоглобин |
16890 |
153 |
1 |
| Гемоглобин |
64500 |
574 |
4 |
| α-Амилаза |
97600 |
? |
2
|
|
Таблица 2. Классификация простых белков,
основанная на их растворимости.
Модификация: Березов Т.Т., Коровкин Б. Ф. Биологическая химия.
3-е изд., М.: Медицина, 1998. 704 с. |
Белки |
Растворимость, особенности содержания аминокислот |
Альбумины |
Растворимы в воде и солевых растворах. Не имеют особенностей по содержанию отдельных аминокислот |
Глобулины |
Слаборастворимы в воде, хорошо растворимы в солевых растворах. Не имеют особенностей по содержанию отдельных аминокислот |
Проламины |
Растворимы в 70 ÷ 80%-ном этаноле, нерастворимы в воде и в абсолютном этаноле. Богаты аргинином |
Гистоны |
Растворимы в солевых
растворах |
Склеропротеины |
Нерастворимы в воде и солевых растворах. Повышено содержание глицина, аланина, пролина
|
|
Таблица 3. Классификация сложных белков по виду простетической группы.
Модификация: Березов Т.Т., Коровкин Б. Ф. Биологическая химия. 3-е изд., М.: Медицина, 1998. 704 с. |
Белки |
Простетическая группа |
Пример |
Фосфопротеины |
Фосфорная кислота |
Фосфатаза |
Гликопротеины |
Углевод |
Гликопротеины жидкостей организма, мембран клеток |
Нуклеопротеины |
Нуклеиновая кислота |
Нуклеопротеины хромосом |
Хромопротеины |
Пигмент |
Гемоглобин, цитохром |
Липопротеины |
Липид |
Компоненты мембран клеток, липопротеины крови (транспортируемая форма липидов) |
Флавопротеины |
Флавинадениннуклеотид |
Аэробные дегидрогеназы - ферменты, участвующие в окислительно-восстановительных процессах в тканях |
Металлопротеины |
Металл |
Металлоферменты
|
|
Таблица 4. Основные функции белков.
Модификация: Березов Т.Т., Коровкин Б. Ф. Биологическая химия. 3-е изд., М.: Медицина, 1998. 704 с. |
Функции |
Белки |
Каталитическая |
Ферменты |
Сократительная |
Актины, миозины |
Регуляция работы генов |
Гистоны, негистоновые ядерные белки |
Гормональная |
Инсулин |
Защитная |
Фибрин, иммуноглобулины, интерферон |
Регуляторная |
Кальмодулин |
Структурная |
Коллаген, эластин, кератины |
Транспортная |
Альбумины (переносят билирубин, жирные кислоты и т. д.), гемоглобин (кислород), липопротеины (различные липиды), трансферрин
|
|
Главными составляющими белков являются углерод, водород, кислород и азот. Некоторые белки образуют комплексы с другими молекулами, содержащими фосфор, железо, цинк, медь и некоторые другие вещества.
По структуре молекулы белков представляют собой цепи, построенные из аминокислот. Карбоксильные группы, –COOH и аминогруппы, –NH2 аминокислот могут соединяться. Каждое такое соединение называют пептидной связью, компоненты пептидной связи называют аминокислотными остатками, а получившееся при соединении двух и более аминокислот вещество называют пептидом. Таким образом, пептид - это вещество, состоящее из двух и более аминокислотных остатков, связанных пептидной связью. Простые пептиды, состоящие из нескольких аминокислот (как правило, 2 ÷ 10) называют олигопептидами. В зависимости от того, сколько аминокислот содержит олигопептид его называют ди-, три-, тетрапептидом и т.д. (см. в отдельном окне схему : Образование дипептида из двух аминокислот посредством пептидной связи.) Пептиды, состоящие из более чем 10 аминокислотных остатков (до нескольких тысяч) называют полипептидами. Молекула белка может состоять из одной или нескольких полипептидных цепей.
Условной границей между крупными полипептидами и белками считают область значений молекулярных масс 8000 ÷ 10000.
Все белки разделяют на простые и сложные. Простые белки состоят только из аминокислот. Сложные белки кроме аминокислот содержат неаминокислотные компоненты. Неаминокислотную часть сложного белка называют простетической группой. К простетическим группам относятся: гем, производные витаминов, липидные или углеводные компоненты.
Белки играют центральную роль в жизнедеятельности клеток. Они формируют структуры клеток, белковые ферменты участвуют в управлении функциями клеток. Анализ содержания в крови определенных белков и ферментов широко используется в медицинской диагностике. В частности, при заболеваниях печени диагностическое обследование обязательно включает оценку относительного содержания альбуминов и глобулинов в плазме крови. Оценка содержания липопротеинов и иммуноглобулинов в плазме обычно используется при диагностике специфических типов гиперлипопротеинемии и иммунных нарушений. Моча человека в норме не
содержит белков; поэтому обнаружение в моче даже небольших количеств белка (протеинурия) является важным показателем заболевания почек.
В данной статье рассматриваются общие свойства простейших белков. Свойства специфических простых белков, таких как коллаген, сократительные белки (актины, миозины), а также свойства специфических сложных белков, таких как гемопротеины (гемоглобин, миоглобин), гликопротеины, липопротеины, рассматриваются отдельно в соответствующих статьях.
Единой общепринятой классификации белков не существует. Несколько наиболее употребительных систем классификации, используемых в клинической практике, в определенной степени противоречат одна другой. Существующие системы классификации основаны на различиях в структуре, в физических свойствах и в функциях. Простейшей классификацией является рассмотренное выше деление белков на простые и сложные.
Глобулярные белки характеризуются компактной укладкой полипептидных цепей. К глобулярным белкам относятся: инсулин, альбумины и глобулины плазмы крови, многие ферменты.
Фибриллярные белки состоят из пучков полипептидных цепей, спирально навитых друг на друга и связанных между собой поперечными ковалентными или водородными связями. К фибриллярным белкам относятся кератин, миозин, коллаген и фибрин.
В зависимости о функций белки разделяют на следующие группы: структурные белки, каталитические белки (ферменты) и транспортные белки. В свою очередь ферменты разделяют по
типу реакции, которую они катализируют.
Литература. Иллюстрации. References. Illustrations
Щелкни здесь и получи доступ в библиотеку сайта! Click here and receive access to the reference library!
- Воробьев А.И., ред. Руководство по гематологии. Двухтомник. М., Медицина, 1985, 780 с.
Иллюстрированный справочник, том 1.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Воробьев А.И., ред. Руководство по гематологии. Двухтомник. М., Медицина, 1985, 780 с.
Иллюстрированный справочник, том 2.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Дерябина Г.И., Соловов А.В. и др. Органическая химия. Кафедра органической химии Самарского госуниверситета.
Тщательно разработанный и хорошо иллюстрированный учебник для средней школы. Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://cnit.ssau.ru/organics/ quotation
- Мари Р., Греннер Д., Мейес П., Родуэлл В. Биохимия человека. Пер. с англ., т. 1-2, М.: Мир, 1993, т. 1, 384 с. Murrey R.K., Granner D.K., Mayes P.A., Rodwell V.W. Harper's Biochemistry, Twenty-first Edition, Appleton & Lange, 1988. См. последнее издание ниже: Murray R.K., Granner D.K., Mayes P.A., Rodwell V.W. Harper's Illustrated Biochemistry, 26th ed., 2003, 693 p.
Тщательно разработанное и хорошо иллюстрированное учебное руководство. Доступ к данному источнику = Access to the reference. Файл в формате DJVU. Просмотр в Internet Explorer.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Мари Р., Греннер Д., Мейес П., Родуэлл В. Биохимия человека. Пер. с англ., т. 1-2, М.: Мир, 1993, т. 2, 415 с. Murrey R.K., Granner D.K., Mayes P.A., Rodwell V.W. Harper's Biochemistry, Twenty-first Edition, Appleton & Lange, 1988.
Тщательно разработанное и хорошо иллюстрированное учебное руководство. Доступ к данному источнику = Access to the reference. Файл в формате DJVU. Просмотр в Internet Explorer.
URL: http://lib.prometey.org/?id=14150 quotation
- Молекулярно-биологические базы данных. Институт математических проблем биологии РАН, 2001.
Названия, адреса наиболее известных баз данных. Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.jcbi.ru/baza/prot.shtml quotation
- Anderson N.L., and Anderson N.G. The Human Plasma Proteome. History, Character, and Diagnostic Prospects = Протеом плазмы крови человека. История. Характер и диагностические перспективы. Molecular & Cellular Proteomics, 2002, 1, 845-867. Обзор.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Baggott J., Dennis S.E Medical Biochemistry = Медицинская биохимия.
Тщательно разработанные и хорошо иллюстрированные учебные материалы. Литература.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www-medlib.med.utah.edu/NetBiochem/titles.htm quotation
- Gilbert S. Omenn G.S., Menon R., Adamski M., Blackwell T., Haab B.B. The Human Plasma and Serum Proteome = Протеом плазмы крови и сыворотки человека, In: Thongboonkerd V., Ed. Proteomics of Human Body Fluids. Principles, Methods, and Applications. Humana Press 2007, 536 p.
Учебное пособие.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Haeberli A., Ed. Human Protein Data = Протеины человека. Данные. Wiley, 1998, 918 p.
Иллюстрированный справочник. 314 белков человека.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Hettiarachchy N.S., Sato K.,, Marshall M.R., Kannan A., Eds. Bioactive Food Proteins and Peptides: Applications in Human Health = Биоактивные пищевые белки и пептиды. CRC, 2011, 348 p.
Учебные материалы.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Honjo T., Alt F.W. Immunoglobulin Genes = Гены иммуноглобулина. 2nd ed., Academic Press, 1995, 463 p. Иллюстрированное учебное пособие.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- King M.W. Medical Biochemistry = Медицинская биохимия . Terre Haute Center for Medical Education.
Тщательно разработанное и хорошо иллюстрированное учебное руководство. Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://web.indstate.edu/thcme/mwking/subjects.html quotation
- Knut & Alice Wallenberg foundation. The Human Protein Atlas = Атлас белков человека. Knut & Alice Wallenberg foundation. Научный проект. Сайт.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.proteinatlas.org/search/blood+proteins quotation
- Liebler D.C. Introduction to Proteomics. Tools for the New Biology = Введение в протеомику. Новые инструменты в биологии. Humana Press, 2002, 210 p. Иллюстрированное учебное пособие.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Liu B. C.-S., Ehrlich J.R., Eds. Tissue Proteomics Pathways, Biomarkers, and Drug Discovery = Протеомика тканей: пути, биомаркеры и открытие медикаментов, Humana Press 2008, 231 p.
Учебное пособие.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Murray R.K., Granner D.K., Mayes P.A., Rodwell V.W. Harper's Illustrated Biochemistry, 26th ed., 2003, 703 p.
Тщательно разработанное и хорошо иллюстрированное руководство. См. выше перевод на русский язык: Мари Р.К.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Nezlin R. The Immunoglobulins: Structure and Function = Иммуноглобулины: структура и функции. Academic Press, 1998, 284 p. Учебное пособие.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Schaller J., Gerber S., Kaempfer U., Lejon S., Trachsel Ch. Human Blood Plasma Proteins: Structure and Function = Протеины плазмы крови человека: структура и функции. Wiley, 2008, 525 p. Иллюстрированное учебное пособие.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- The Human Proteome Project = Протеом человека. 2012. Протеом человека — международный научный проект, направленный на идентификацию всех белков человека. Сайт.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.thehpp.org/status.php quotation
- Thongboonkerd V., Ed. Proteomics of Human Body Fluids. Principles, Methods, and ApplicationsThe Human Plasma and Serum Proteome = Протеом жидкостей тела человека. Humana Press 2007, 536 p.
Учебное пособие.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Twyman R. Principles of Proteomics = Принципы протеомики. Bios Scientific Pub Ltd, 2004, 400 p.
Учебное пособие.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.tryphonov.ru/tryphonov/serv_r.htm#0 quotation
- Von Worthington. Worthington Enzyme Manual. Enzymes and Related Biochemicals.
Ферменты и другие вопросы биохимии.
Тщательно разработанные и хорошо иллюстрированные справочные материалы. Литература.
Доступ к данному источнику = Access to the reference.
URL: http://www.worthington-biochem.com/index/manual.html quotation
См.: Химия: Литература. Иллюстрации, Биохимия человека: Литература. Иллюстрации.
|
«Я У Ч Е Н Ы Й И Л И . . . Н Е Д О У Ч К А ?»
Т Е С Т В А Ш Е Г О И Н Т Е Л Л Е К Т А
Предпосылка:
Эффективность развития любой отрасли знаний определяется степенью соответствия методологии познания - познаваемой сущности.
Реальность:
Живые структуры от биохимического и субклеточного уровня, до целого организма являются вероятностными структурами. Функции вероятностных структур являются вероятностными функциями.
Необходимое условие:
Эффективное исследование вероятностных структур и функций должно основываться на вероятностной методологии (Трифонов Е.В., 1978,..., ..., 2015, …).
Критерий: Степень развития морфологии, физиологии, психологии человека и медицины, объём индивидуальных и социальных знаний в этих областях определяется степенью использования вероятностной методологии.
Актуальные знания: В соответствии с предпосылкой, реальностью, необходимым условием и критерием...
...
о ц е н и т е с а м о с т о я т е л ь н о:
— с т е п е н ь р а з в и т и я с о в р е м е н н о й н а у к и,
— о б ъ е м В а ш и х з н а н и й и
— В а ш и н т е л л е к т !
|
♥ Ошибка? Щелкни здесь и исправь ее! Поиск на сайте E-mail автора (author): tryphonov@yandex.ru
|